Napetost raste dok se Thomas i njegovi prijatelji suočavaju s dosad najvećim izazovima. Moraju se kretati kroz podmukle hodnike Labirinta dok ih progone nemilosrdni Grieversi, mehanička stvorenja koja lutaju Labirintom i predstavljaju smrtonosnu prijetnju. Vrhunac doseže svoj vrhunac kada se Thomas suoči s tvorcem labirinta, Avom Paige, i propituje moralnost i motive koji stoje iza WCKD-ova eksperimenta.
Usred kaosa i opasnosti, Thomas i Gladerovi otkrivaju tajne iza Labirinta i razloge njihovog zatočeništva. Pomiruju se sa žrtvama koje moraju podnijeti kako bi se oslobodili i razotkrili istinu o namjerama WCKD-a.
Vrhunac Trkača u labirintu obilježen je intenzivnim akcijskim sekvencama, emocionalnim sukobima i otkrićima koja mijenjaju tijek priče i postavljaju pozornicu za događaje koji će se odvijati u sljedećim knjigama serijala.