Rezultati Geigera i Marsdena pokazali su da:
* Većina alfa čestica prošla je ravno kroz zlatnu foliju. To je bilo u skladu s modelom pudinga od šljiva, jer se smatralo da je pozitivan naboj raširen po atomu.
* Mali dio alfa čestica bio je odbijen pod velikim kutovima, a neke su se čak raspršile natrag prema izvoru. To je bilo potpuno neočekivano i nije se moglo objasniti modelom pudinga od šljiva.
Ovi neočekivani rezultati doveli su do razvoja novog modela atoma od strane Ernesta Rutherforda 1911. Predložio je nuklearni model , koji je sugerirao da:
* Atom ima malu, gustu, pozitivno nabijenu jezgru u središtu. Ova je jezgra odgovorna za najveći dio mase atoma.
* Negativno nabijeni elektroni kruže oko jezgre na način poput oblaka.
Nuklearni model uspješno je objasnio rezultate Geigerova i Marsdenova eksperimenta. Velika uočena otklona uzrokovana su sudarom alfa čestica s pozitivno nabijenom jezgrom, dok je većina čestica prošla jer je atom većinom prazan prostor.
Stoga, nuklearni model atoma je podržan Geigerovim i Marsdenovim rezultatima.