Točan mehanizam koji stoji iza menstrualne sinkronizacije još uvijek je nejasan i zahtijeva daljnja istraživanja. Neke teorije sugeriraju da feromoni, kemijski signali koje ispušta tijelo, mogu igrati ulogu u usklađivanju menstrualnih ciklusa žena u neposrednoj blizini. Međutim, znanstvena zajednica nije postigla konsenzus o postojanju ili temeljnim uzrocima menstrualne sinkronije.