2. Pronađite tajnu lokaciju baze. Postoji mnogo različitih lokacija tajnih baza diljem Sinnoha. Neke od najpopularnijih lokacija uključuju:
* Otočić na cesti 218
* Špilja blizu ulaza u Izgubljeni toranj na cesti 213
* Kuća u Pastoria City koja je u izgradnji
3. Koristite Secret Base Kit. Nakon što pronađete lokaciju tajne baze, upotrijebite Secret Base Kit za izradu svoje baze. Možete odabrati vrstu baze koju želite izraditi, a možete je i ukrasiti namještajem i drugim predmetima.
4. Zapošljavajte članove tima. Možete regrutirati druge igrače da se pridruže vašem tajnom osnovnom timu. Da biste to učinili, razgovarajte s osobom koju želite regrutirati i odaberite opciju "Regrut".
5. Borite se protiv drugih timova. Možete se boriti protiv tajnih baza drugih timova tako da razgovarate s osobom na ulazu u bazu i odaberete opciju "Bitka". Tajne bitke u bazi su bitke 2-na-2, a pobjednik je tim koji prvi nokautira Pokemona oba protivnika.
6. Zaradite bodove i nagrade. Možete zaraditi bodove pobjeđujući u bitkama u tajnim bazama i ispunjavajući misije u tajnim bazama. Bodove možete koristiti za kupnju predmeta u trgovini Secret Base Shop, a možete ih koristiti i za nadogradnju svoje tajne baze.