Groudon (prizemni tip)
* Pronađen u Cave of Origin nakon što je pobijedio Elite Four i postao prvak.
* Može se uhvatiti samo nakon dobivanja crvene kugle.
Kyogre (vodeni tip)
* Pronađen u Cave of Origin nakon što je pobijedio Elite Four i postao prvak.
* Može se uhvatiti samo nakon dobivanja Plave kugle.
Rayquaza (zmaj/leteći tip)
* Pronađen u Nebeskom stupu nakon što su Groudon i Kyogre poraženi.
* Može se uhvatiti samo nakon dobivanja crvene kugle i plave kugle.
Regirock (Rock-type)
* Pronađen u drevnom hramu u pustinji, dostupan nakon dobivanja tri Regi ključa.
* Morate aktivirati hram korištenjem ključeva određenim redoslijedom.
Regice (Ice-type)
* Pronađen u drevnom hramu u pustinji, dostupan nakon dobivanja tri Regi ključa.
* Morate aktivirati hram korištenjem ključeva određenim redoslijedom.
Registeel (tip čelika)
* Pronađen u drevnom hramu u pustinji, dostupan nakon dobivanja tri Regi ključa.
* Morate aktivirati hram korištenjem ključeva određenim redoslijedom.
Latias (tip zmaja/vidovnjaka)
* Pronađen na Južnom otoku nakon dobivanja Eon frule.
* Dostupno samo nakon nabave Eon frule.
Latios (tip zmaja/vidovnjaka)
* Pronađen na Južnom otoku nakon dobivanja Eon frule.
* Dostupno samo nakon nabave Eon frule.
Jirachi (čelični/psihički tip)
* Pronađen u Kući željatelja nakon dobivanja Zvjezdanog kamena.
* Ovo je rijedak susret i morat ćete upotrijebiti Star Stone da ga probudite.
Mjau (tip vidovnjaka)
* Tehnički se ne može dobiti kroz normalno igranje. Zahtijeva grešku ili uređaj za varanje za preuzimanje.
Napomena: Iako tehnički možete nabaviti Mewtwo u Pokémon Emeraldu to nije legendarni susret. Može se pronaći u napuštenoj vili Pokémon u području Slateport Cityja.