Ekonomski:
* Gubitak kvalificirane radne snage: Huguenoti su bili visoko kvalificirana i poduzetnička skupina, posebno u zanatu, trgovini i industriji. Njihov progon doveo je do značajnog egzodusa, lišavajući Francusku vrijedan ljudski kapital.
* Ekonomska stagnacija: Emigracija Huguenota također je ometala razvoj francuske industrije i trgovine, što je dovelo do ekonomske stagnacije i usporavanja rasta.
* Oštećena reputacija: Progon Huguenota omamljen je imidžom Francuske u inozemstvu, odvraćajući strana ulaganja i trgovinu.
Social:
* Gubitak stanovništva: Egzodus Huguenota rezultirao je značajnim gubitkom stanovništva, oslabivši ukupne ljudske resurse Francuske.
* Društveni nemiri: Progon i nasilje nad Huguenotima stvorili su socijalne nemire i nestabilnost, što je dovelo do ustanka i oružanih sukoba.
* Podjela i polarizacija: Progon je produbio vjerske podjele i polarizaciju unutar francuskog društva, stvarajući trajne društvene napetosti.
Politički:
* Slabljenje monarhije: Progon Huguenota otuđio je značajan dio stanovništva i oslabio autoritet monarhije, doprinoseći nestabilnosti i budućim pobunama.
* Povećana politička nestabilnost: Huguenotovi ratovi i tekući vjerski sukobi stvorili su klimu političke nestabilnosti, ometajući sposobnost Francuske da konsolidira vlast i ostvari nacionalne ciljeve.
Kulturno:
* Gubitak kulturne raznolikosti: Progon Huguenota rezultirao je gubitkom jedinstvene kulturne baštine, budući da su njihovi doprinosi francuskoj umjetnosti, književnosti i filozofiji umanjeni.
Dugoročni učinci:
* Francuska iseljavanje: Progon Huguenota potaknuo je val francuske iseljavanja, a Huguenoti su se naselili u zemljama poput Njemačke, Engleske, Nizozemske i Amerike, obogaćujući ta društva dok je doprinijelo odljevu mozga iz Francuske.
* Nasljeđe progona: Progon Huguenota ostavio je trajnu oznaku francuske povijesti, služeći kao podsjetnik na vjersku netoleranciju i njegove razorne posljedice.
Zaključno, progon Huguenota bio je skupa pogreška za Francusku. To je dovelo do značajnih ekonomskih, socijalnih, političkih i kulturnih gubitaka, a njegove posljedice i dalje su odjeknule dugo nakon završetka vjerskih ratova. Emigracija Huguenota imala je posebno trajan utjecaj, jer je pridonijela rastu i prosperitetu drugih naroda, istovremeno slabivši vlastiti razvoj Francuske.