1. Suite za violončelo :Komplet od šest suita za solo violončelo, nastalih između 1717. i 1723. Ove se suite smatraju jednima od najzahtjevnijih i tehnički najizazovnijih skladbi repertoara za violončelo.
2. Brandenburški koncerti :Skup od šest koncerata napisanih za različite kombinacije instrumenata, nastalih oko 1721. Koncerti su nazvani po Christianu Ludwigu, markgrofu od Brandenburga, kojemu su posvećeni.
3. Dobro temperirani klavir (I. i II. knjiga) :Zbirka od 48 preludija i fuga u sva 24 durska i molska tonaliteta, skladana 1722. i objavljena 1744. Dobro temperirani klavir je pedagoško djelo koje pokazuje mogućnosti jednakog temperamentnog ugađanja i smatra se prekretnicom u glazbi za klavijature.
4. Goldbergove varijacije :Skup od 30 varijacija na jednostavnu temu, nastao oko 1741.-1742. Djelo je izvorno napisano za čembalo, ali se često izvodi na klaviru.
5. Šest partita :Skup od šest svita za klavijature nastalih između 1725. i 1730., od kojih se svaka sastoji od nekoliko plesnih stavaka.
6. Francuski apartmani :Komplet od šest svita za klavijature skladanih u stilu francuske dvorske glazbe, napisanih oko 1725.
7. Engleski apartmani :Skup od šest svita za klavijature skladanih u stilu engleske dvorske glazbe, napisanih oko 1717.
8. Invencije i simfonije :Dvije zbirke kratkih skladbi za klavijature nastale između 1720. i 1723., prvenstveno u pedagoške svrhe.
9. Orgelbüchlein (Mala knjiga orgulja) :Zbirka od 46 kratkih orguljskih korala nastalih između 1717. i 1718. godine.
10. Misa u h-molu :Jedna od Bachovih najpoznatijih i najmonumentalnijih skladbi, Misa u h-molu je zborsko djelo velikih razmjera, nastalo između 1733. i 1749., koje uključuje različite glazbene oblike kao što su fuge, arije i korali.
Ove skladbe predstavljaju samo mali dio Bachova golemog stvaralaštva, koje uključuje i brojna druga instrumentalna djela, kantate, motete, strasti i svjetovna vokalna djela. Bachova djela nastavljaju se cijeniti i izvoditi u cijelom svijetu zbog svoje iznimne glazbene kvalitete, tehničkog majstorstva i dubokog emocionalnog izražaja.