1. Pretjerano pojednostavljivanje složenih povijesnih pitanja :Neki povjesničari tvrde da je dokumentarac prikazao određene složene povijesne događaje na pojednostavljen ili čak romantiziran način, bez potpunog istraživanja njihovih nijansi i složenosti. Na primjer, neki su osporili prikaz rata kao izravnog moralnog sukoba između herojskog Sjevera i zlobnog Juga jer su zanemarili čimbenike poput državnih prava i ekonomskih interesa koji su utjecali na obje strane.
2. Nedostatak različitih perspektiva :Kritičari su istaknuli da se dokumentarac uglavnom fokusirao na iskustva bijelih pojedinaca i vođa, pridajući manje pozornosti iskustvima i doprinosima Afroamerikanaca, žena, Indijanaca i drugih marginaliziranih skupina tijekom rata. Neki su povjesničari tvrdili da bi inkluzivniji narativ mogao pružiti bogatije i sveobuhvatnije razumijevanje sukoba.
3. Nedovoljna kontekstualizacija :Dok je dokumentarac pružao detaljan prikaz vojnih događaja, neki povjesničari vjeruju da je mogao pružiti više konteksta u vezi s društvenim, političkim i ekonomskim silama koje su dovele do rata. Tvrdili su da bi gledatelji mogli steći dublje razumijevanje uzroka sukoba da su ti širi povijesni čimbenici dublje istraženi.
4. Nedostatak pažnje prema klasnim podjelama :Neki kritičari smatraju da se dokumentarac nije na odgovarajući način bavio klasnim podjelama i nejednakostima unutar sjevernog i južnog društva. Tvrdili su da je isticanje ovih razlika moglo pružiti nijansiraniju analizu društvene dinamike tijekom ratnog razdoblja.
5. Ograničena rasprava o posljedicama rata :Dok je dokumentarac pokrivao glavne događaje građanskog rata, razmjerno je manje pozornosti posvetio eri rekonstrukcije i njezinu utjecaju na kasniji razvoj Sjedinjenih Država. Neki su povjesničari tvrdili da bi temeljitije istraživanje ovog razdoblja moglo rasvijetliti trajno nasljeđe rata.
Vrijedno je napomenuti da ove kritike predstavljaju samo ograničenu perspektivu, a mnogi drugi povjesničari i znanstvenici hvale "Građanski rat" zbog njegovog doprinosa razumijevanju povijesti, pripovijedanju i javnom angažmanu. Dokumentarac ostaje jedan od najutjecajnijih i najcjenjenijih povijesnih dokumentaraca ikada snimljenih.