Gysijevo najvažnije djelo bila je njegova knjiga, _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908.), u kojem je opisao svoja proučavanja anatomije i funkcije temporomandibularnog zgloba. Također je razvio nekoliko instrumenata i tehnika za mjerenje okluzije i artikulacije, uključujući Gysi Simplex artikulator .
Gysijev rad imao je dubok utjecaj na razvoj stomatologije, a smatra se i jednim od očeva moderne okluzije i artikulacije.
Evo popisa nekih od najvažnijih djela Alfreda Gysija:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897.)
* _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908.)
* _Problem artikulacije_ (1910.)
* _Udžbenik protetske stomatologije_ (1915.)
* _Studije o mandibularnom zglobu_ (1929.)
* _Der Kauapparat des Menschen_ (1940.)
Gysijev rad preveden je na mnoge jezike, a dobio je brojne nagrade i priznanja za svoj doprinos stomatologiji. Smatra se jednom od najvažnijih osoba u povijesti stomatologije.