Pojačivači:Ovo su DNK sekvence koje vežu faktore transkripcije i potiču transkripciju obližnjih gena. Na primjer, pojačivač u lokusu teškog lanca imunoglobulina odgovoran je za visoku razinu ekspresije ovih gena u B stanicama.
Promotori:To su DNA sekvence koje vežu RNA polimerazu i iniciraju transkripciju gena. Na primjer, promotor u genu ljudskog hormona rasta odgovoran je za ekspresiju ovog gena u hipofizi.
Prigušivači:To su DNK sekvence koje vežu faktore transkripcije i potiskuju transkripciju obližnjih gena. Na primjer, prigušivač u ljudskom genu za β-globin odgovoran je za potiskivanje ovog gena u ne-eritroidnim stanicama.
Transakcijski nizovi:
Transkripcijski faktori:To su proteini koji se vežu na cis-djelujuće sekvence i reguliraju transkripciju gena. Na primjer, transkripcijski faktor Oct-1 veže se na oktamerni motiv u pojačivaču teškog lanca imunoglobulina i potiče transkripciju ovih gena u B stanicama.
RNA polimeraza:Ovo je proteinski kompleks koji se veže na promotore i prepisuje gene u RNA.
Ostali regulatorni proteini:To su proteini koji se vežu na cis-djelujuće sekvence i reguliraju transkripciju gena na različite načine. Na primjer, protein CTCF veže se na CCCTC motiv u ljudskom genu za β-globin i pomaže organizirati strukturu kromatina ove regije, što je neophodno za potiskivanje gena u neeritroidnim stanicama.