Ubojstvo u Orient Expressu zadire u temu identiteta i njegove složenosti. Roman predstavlja nekoliko likova s različitim podrijetlom, kulturama i planovima, od kojih svaki skriva skriveni identitet ili nosi tajne. Poirot, detektiv, mora pogledati izvan površine kako bi utvrdio prave karaktere i motive putnika.
Tema pravde također igra značajnu ulogu u priči. Poirot nastoji ne samo riješiti zločin, već i osigurati da pravda bude zadovoljena. Putnici se suočavaju s etičkom dilemom kada se okupe kako bi odlučili o ubojičevoj sudbini. Moraju odlučiti hoće li slijediti stroge zakonske procedure ili uzeti stvari u svoje ruke kako bi postigli osjećaj pravde za koji vjeruju da je neophodan.
Roman postavlja intrigantna pitanja o složenosti ljudskog identiteta, dvosmislenosti morala i potrazi za istinom i poštenjem.