Flauta također ima sustav ključeva koji omogućuje sviraču jednostavno i brzo otvaranje i zatvaranje tonskih rupa. Ovaj sustav tipki sastoji se od niza poluga i šipki koje su spojene na tonske otvore. Kada se tipka pritisne, otvara odgovarajući tonski otvor, a kada se tipka otpusti, zatvara odgovarajući tonski otvor.
Mijenjanjem duljine zračnog stupca te otvaranjem i zatvaranjem tonskih rupa, flautist može proizvesti širok raspon nota. Najniža nota koju flauta može proizvesti je C ispod srednjeg C, a najviša nota koju flauta može proizvesti je C tri oktave iznad srednjeg C.