Rupe na klarinetu nazivaju se tonske rupe. Kada se otvor za tone otvori, dopušta da dio zraka izađe iz stupca zraka, što skraćuje stupac i podiže visinu zvuka. Kada je tonska rupa zatvorena, ona blokira izlazak zraka iz stupca zraka, što produljuje stupac i snižava visinu zvuka.
Specifična visina svake note određena je duljinom zračnog stupca i napetosti trske. Zategnutost trske kontrolira se sviračevim embouchureom, odnosno načinom na koji drže usta i pušu u nastavak za usta.