- Garvan-Olinova medalja Američkog kemijskog društva (1983.):Ova prestižna nagrada prepoznaje izvanredna postignuća u polju kemije.
- Tolmanova medalja Južnokalifornijske sekcije Američkog kemijskog društva (1985.):Ova se nagrada dodjeljuje osobi koja je značajno doprinijela polju kemije.
- Nagrada stipendista Američke udruge za napredak znanosti (AAAS) (1987.):Ova se nagrada dodjeljuje pojedincima koji su dali izniman doprinos napretku znanosti.
- Nagrada Nacionalne organizacije za žene (NOW) Žena godine (1990.):Ova nagrada prepoznaje značajan doprinos žena u raznim područjima.
- Nagrade L'Oréal-UNESCO za žene u znanosti (2005.):Marie Daly bila je jedna od pet dobitnica ove nagrade, kojom se prepoznaju iznimna postignuća žena u znanstvenom istraživanju.
- Nacionalna medalja za znanost (2005.):Ovo je jedno od najviših priznanja koja se dodjeljuju znanstvenicima u Sjedinjenim Državama, kao priznanje za njihov izniman doprinos ovom području.
Postignuća i utjecaj Marie M. Daly na polju kemije naširoko su priznati i slavljeni, a njezine nagrade služe kao potvrda njezinih iznimnih postignuća i doprinosa.