Međutim, poznato je da je u 15. stoljeću osnovao školu plovidbe u Sagresu u Portugalu. Ova škola, koja nije bila formalna ustanova, već središte učenja i eksperimentiranja, igrala je ključnu ulogu u razvoju portugalskog pomorskog istraživanja. Privukao je znanstvenike, navigatore, kartografi i brodograditelje koji su zajedno radili na poboljšanju nautičkih tehnika i dizajniranim boljim brodovima.
Dakle, dok princ Henry nije sam pohađao školu, zaslužan je za uspostavljanje škole za plovidbu, koja je bila presudna za doba istraživanja.