Dobro protiv zla: Roman istražuje klasičnu temu dobra protiv zla, koju predstavljaju Sherlock Holmes i Pas. Holmes utjelovljuje moć razuma i dedukcije, dok Pas simbolizira sile tame i praznovjerja.
Ljudsko stanje: Roman također zadire u ljudsko stanje, posebno teme straha, krivnje i iskupljenja. Sir Henryja Baskervillea progoni prokletstvo njegove obitelji, dok se dr. Mortimer bori s krivnjom zbog smrti Sir Charlesa Baskervillea. Holmes, međutim, predstavlja pobjedu ljudskog intelekta nad praznovjerjem i strahom.