Na početku romana glavni likovi, Claudia i Jamie Kincaid, bježe od kuće i odlučuju živjeti u muzeju. Dok istražuju muzej, slučajno naiđu na tajni životni prostor gospođe Frankweiler. Gospođa Frankweiler je ljubazna i ekscentrična starija žena i dopušta Claudiji i Jamieju da ostanu s njom u muzeju.
Kako roman odmiče, otkriva se da gospođa Frankweiler ima duboku ljubav i povezanost s muzejom. Tamo već godinama potajno živi i poznaje svaki kutak mjesta. Također je talentirana umjetnica, a stvara prekrasne skulpture i slike koje skriva po muzeju.
Kroz svoj odnos s Claudijom i Jamiejem, gospođa Frankweiler može svoju ljubav prema muzeju podijeliti s drugima. Ona ih uči o povijesti i umjetnosti muzeja i pomaže im da cijene ljepotu i čuda svijeta oko sebe.
Na kraju je tajna gospođe Frankweiler otkrivena, ali joj je dopušteno da nastavi živjeti u muzeju. Postaje voljeni član muzejske zajednice, a svoju ljubav prema umjetnosti i ljepoti nastavlja dijeliti s drugima.
Veza između muzeja i gospođe Basil E. Frankweiler središnja je tema romana i naglašava važnost umjetnosti i kulture u našim životima.