Tijekom igranja karte se mogu odbaciti iz različitih razloga, kao što su:
- Igranje određenih trenerskih i Pokemon karata koje zahtijevaju odbacivanje drugih karata kao trošak
- Odbacivanje kao rezultat određenih napada, sposobnosti ili učinaka
- Dobrovoljno odbacivanje karata iz ruke za izvlačenje karata iz špila na kraju poteza
- Kazna za kršenje određenih pravila igre, kao što je pokušaj igranja previše osnovne energije na istom potezu.