* Ton: Gravity Falls je lakša i komičnija serija, dok je Mystery Incorporated mračnija i ozbiljnija. Gravity Falls često sadrži slapstick komediju i humor temeljen na igri riječi, dok je Mystery Incorporated napetiji i više se oslanja na humor s temom horora.
* Likovi: Likovi u Gravity Fallsu su ekscentričniji i neobičniji, dok su likovi u Mystery Incorporated realističniji i srodniji. Veća je vjerojatnost da će likovi iz Gravity Fallsa upasti u otkačene situacije i imati čudne sposobnosti, dok će likovi iz Mystery Incorporated vjerojatnije biti uključeni u ozbiljne istrage i suočiti se sa stvarnom opasnošću.
* Postavka: Gravity Falls je smješten u malom, izoliranom gradu u Oregonu, dok je Mystery Incorporated smješten u izmišljenom gradu Crystal Cove u Kaliforniji. Gravity Falls je više natprirodno okruženje, sa čudnim stvorenjima i događajima koji se redovito pojavljuju, dok je Crystal Cove normalnije okruženje, s misterijama koje obično uzrokuju ljudski kriminalci.
* Format: Gravity Falls je serijalizirana serija, pri čemu se svaka epizoda nadovezuje na prethodne epizode i vodi do veće sveobuhvatne priče. Mystery Incorporated više je epizodan, a svaka epizoda je samostalna priča.
Sve u svemu, Gravity Falls i Scooby-Doo Mystery Incorporated izvrsne su animirane serije misteriozne komedije, ali imaju različite snage i slabosti. Gravity Falls je ležernija i komičnija serija s više ekscentričnih likova, dok je Mystery Incorporated mračnija i ozbiljnija serija s realističnijim likovima.