* Individualne prednosti i slabosti: Različiti Pokémoni imaju različite statistike, poteze i sposobnosti, što ih čini boljim u različitim scenarijima.
* Obuka i razine: Dobro uvježban Pokémon visoke razine uvijek će biti jači od onog niže razine, bez obzira na njegovu vrstu.
* Strategija i vještina igrača: Način na koji igrač koristi svoje Pokémone u borbi može uvelike utjecati na njihovu učinkovitost.
Međutim, neki se Pokémoni često smatraju vrlo moćnima u Pokémon Crystalu zbog svojih jakih statistika i skupova pokreta:
* Mewtwo: Vjerojatno najmoćniji Pokémon u cijeloj franšizi, Mewtwo je vidovnjak s nevjerojatnom statistikom i pristupom moćnim pokretima poput vidovnjaka i psybeama.
* Tiranitar: Pseudo-legendarni Pokémon sa golemim napadom i obranom, Tyranitar je sila na koju se treba računati u bitkama.
* Gyarados: Svojim prepoznatljivim pokretom Plesa zmaja, Gyarados može postati nevjerojatno moćan i pomesti cijele timove.
* Dragonit: Još jedan pseudo-legendarni Pokémon, Dragonite je moćan tip letećeg/zmaja sa sjajnim pokretnim resursom.
* Alakazam: Vidovnjački tip s nevjerojatnim specijalnim napadom, Alakazam može biti nevjerojatno moćan kada se učinkovito koristi.
* Snorlax: Iako spor, Snorlax ima nevjerojatnu količinu HP-a i obrane, što ga čini teškim za srušiti.
U konačnici, "najmoćniji" Pokémon u Crystalu ovisi o individualnim preferencijama, stilu igre i specifičnim izazovima s kojima se suočavate.