Evo kako Shadow Pokémon sustav radi u Xenogearsu:
1. Padanje u nesvijest Shadow Pokémona: Možete onesvijestiti Shadow Pokémone u bitkama, baš kao i bilo kojeg drugog neprijatelja. Ovo ih zapravo ne "zarobljava".
2. Pravo značenje "hvatanja": Čin "hvatanja" Shadow Pokémona u Xenogearsu znači poraziti ga u borbi a zatim upijajući njihovu energiju i sjećanja u vlastite likove . To se postiže upotrebom sposobnosti "Snimanje" , koji je dostupan određenim likovima.
3. Sposobnost "Snimanje": Sposobnost "Snimanje" nije nešto što naučite ili kupite; to je dio inherentnih sposobnosti lika. Kada lik može koristiti sposobnost "Hvatanje", moći ćete vidjeti posebnu naredbu tijekom bitke nakon pobjede nad Pokémonom iz sjene. Korištenje ove naredbe omogućit će vam da apsorbirate njihovu energiju i sjećanja.
Stoga ne možete ponovno "uhvatiti" onesvijestenog Shadow Pokémona. Nakon što pobijedite Shadow Pokémona, ili ga apsorbirate (putem Hvatanja) ili će zauvijek nestati.
Dizajneri igre vjerojatno su odabrali ovaj sustav kako bi naglasili teme gubitka, žrtvovanja i borbe protiv tame koje su ključne za Xenogearsov narativ.