Može se igrati samo u 16-bitnoj igri Sonic &Knuckles , koji je pušten kao zaseban uložak. Zatim možete staviti uložak Sonic &Knuckles na vrh uloška Sonic the Hedgehog 3 da otključate značajku "Lock-on" , što vam omogućuje da igrate kao Knuckles u novoj verziji igre.
Iako se Knuckles ne može izravno igrati u Sonic 3, on se pojavljuje kao šef u igri.