Filmovi:
* Lijepa u ružičastom (1986.) :Ovaj tinejdžerski roman je vjerojatno njegova najpoznatija uloga.
* Superman IV:Potraga za mirom (1987.) :Glumio je ulogu Lennyja Luthora, sina Lexa Luthora.
* Tri mušketira (1993) :Komično viđenje klasične priče u kojoj je glumio Plancheta.
* Vruće fotografije! (1991.) i Hot Shots! Part Deux (1993) :Dva parodija filma s Charliejem Sheenom u glavnoj ulozi, gdje je Cryer igrao sporednu ulogu.
* Glup i gluplji (1994) :Mala, ali nezaboravna uloga konobara.
* Just Visiting (2001) :francusko-američka komedija u kojoj Cryer glumi srednjovjekovnog viteza.
* Problemi s muškarcima (2010.) :romantična komedija sa zvjezdanom postavom.
* Hit Man (2012) :Triler o ubojici koji ima zadatak ubiti američkog senatora.
Televizija:
* Slavni Teddy Z (1989.-1990.) :Njegova prva glavna uloga u TV sitcomu.
* Problemi s Larryjem (1993.-1994.) :Kratkotrajni sitcom u kojem je Cryer glumio naslovnog lika.
* Partneri (2011.-2012.) :Glumio je s Michaelom Uriejem u ovom sitcomu o partnerstvu između dva odvjetnika.
* Dva i pol muškarca (2003.-2015.) :Cryerova uspješna uloga Alana Harpera, koja mu je donijela četiri nagrade Emmy za najbolju sporednu mušku ulogu u humorističnoj seriji.
* Mama (2013.-2021.) :Pridružio se glumačkoj ekipi ovog sitcoma u sezoni 4, igrajući ulogu Adama, ljubavnika Christy (koju glumi Anna Faris).
* Godfather of Harlem (2019.-danas) :Cryer igra ulogu gradonačelnika Roberta Wagnera, korumpiranog gradonačelnika New Yorka tijekom ere šefa kriminala, Bumpyja Johnsona.
Ovo je samo izbor njegovih najznačajnijih projekata. Jon Cryer je tijekom svoje karijere sudjelovao u brojnim drugim filmskim i televizijskim projektima. On je svestran i talentiran glumac koji se pokazao sposobnim igrati i komične i dramske uloge.