- "Zašto križ?" (1901.) :
Ovo je njegovo najpoznatije djelo, koje predstavlja teološko obrazloženje za raspeće Isusa Krista i kako ono označava Božju ljubav i milost.
- "Bojno polje duše:Studija o znanosti o posvećenju" (1903.) :
Ova knjiga istražuje duhovno putovanje kršćanina i kako vjernici trebaju težiti osobnoj svetosti i pobjedi u svojim unutarnjim borbama.
- "Tajna sretnog dana" (1904.) :
Ova knjiga ima za cilj potaknuti pojedince da pronađu sreću i zadovoljstvo približavanjem Bogu i prihvaćanjem života duhovne preobrazbe.
- "Život koji pobjeđuje" (1906.) :
Ovo djelo naglašava važnost vitalnog i pobjedonosnog kršćanskog života, naglašavajući potrebu za snažnom vjerom i dosljednim predanjem Božjoj volji.
- "Ključ kraljevstva" (1907.) :
U ovoj knjizi Johnstone objašnjava učenja Isusa Krista i naglašava važnost osobnog učeništva i življenja u skladu s Božjim zapovijedima.
- "Siguran put spasenja" (1909.) :
Ovo djelo daje jednostavno i sažeto objašnjenje kako pojedinci mogu dobiti spasenje kroz vjeru u Isusa Krista.
- "Božja veličina" (1919.) :
Ova knjiga istražuje Božju veličanstvenost i suverenitet, usredotočujući se na Njegove atribute i način na koji oni utječu na ljudsko razumijevanje i obožavanje.
- "Križ i njegovo značenje" (1930.) :
Johnstone preispituje značaj Kristova raspeća i razjašnjava njegove višestruke implikacije za ljudsko spasenje i pomirenje s Bogom.
Ovo su neki od istaknutih spisa Johna Chalmersa Johnstonea koji pokazuju njegovu teološku dubinu i duhovni utjecaj koji je tijekom godina imao na brojne čitatelje.