Njegovi drugi romani uključuju:
* Ciklus Vrata smrti (1990.-1994.)
* Knjiga crne zemlje (1995.)
* Knjiga bijele ruže (1996.)
* Knjiga crvenog sunca (1997.)
* Praznina (2000.)
* Sfera (2001.)
* Horizont (2002.)
* Veo (2003.)
* Podjela (2005.)
* Prsten (2007.)
* Zid (2008.)
Njegove kratke priče uključuju:
* "The Last of the Winnebagoes" (1987)
* "Oblik stvari" (1989.)
* "Lovčev mjesec" (1991.)
* "Sjena oluje" (1992.)
* "Zdenac tame" (1993.)
* "The Doom of Dragonstar" (1994.)
* "Sudbina bogova" (1995.)
* "Kraj vječnosti" (1996.)
* "Dan kada je Zemlja stala" (1997.)
* "Posljednje pitanje" (1998.)
Njegove zbirke uključuju:
* *William E. Waters:U ravnoteži* (1991.)
* *William E. Waters:The Last of the Winnebagoes and Other Stories* (1993)
* *William E. Waters:Oblik stvari i druge priče* (1995.)
* *William E. Waters:Lovčev mjesec i druge priče* (1997.)
* *William E. Waters:Sjena oluje i druge priče* (1999.)
Waters je također napisao nekoliko knjiga za mlade, uključujući:
* Izgubljene zemlje (2000.-2003.)
* Sjena bogova (2005.)
* Posljednji od vilenjaka (2007.)
* Uspon mračnog gospodara (2009.)
* Bitka Titana (2011.)
* Zora drevnih (2013.)
* Pad Atlantide (2015)
Waters je osvojio brojne nagrade za svoj rad, uključujući World Fantasy Award za Najbolji roman za Tiamatin gnjev i nagradu Locus za Najbolji fantastični roman za The Crystal Shard . Član je Američkih pisaca znanstvene fantastike i fantazije i Udruge pisaca horora.