Séguy je rođen u Toulonu, Francuska, 1. srpnja 1877. Pokazao je strast prema prirodnoj povijesti u mladosti, a počeo je skupljati kukce u dobi od 12 godina. Studirao je medicinu na Sveučilištu u Montpellieru i diplomirao 1902.
Séguy je započeo svoju karijeru kao vojni liječnik, ali se ubrzo posvetio entomologiji. Radio je u Muséum national d'histoire naturelle u Parizu od 1906. do umirovljenja 1942. Tijekom svog vremena u muzeju vodio je zbirku Diptera, te objavio brojne znanstvene članke i knjige na tu temu.
Séguyjevo glavno područje istraživanja bila je obitelj Muscidae, te je postao svjetski stručnjak za ovu skupinu. Opisao je više od 1000 novih vrsta Muscidae, te objavio nekoliko monografija i kataloga o obitelji. Također je radio na drugim obiteljima Diptera, uključujući Tephritidae, Conopidae i Cecidomyiidae.
Osim znanstvenog rada, Séguy je također bio aktivan član nekoliko znanstvenih društava, uključujući Société entomologique de France i Royal Entomological Society of London. Dobitnik je Linneanove medalje Linneanskog društva u Londonu 1939. i Prix Constant od Académie des sciences u Parizu 1949. godine.
Séguy je umro u Parizu 23. listopada 1951. u dobi od 74 godine. Bio je plodan entomolog koji je dao značajan doprinos proučavanju Diptera, a znanstvenici i danas naširoko citiraju njegov rad.