Roman je napisan iz perspektive Bruna, devetogodišnjeg njemačkog dječaka koji nije svjestan prave prirode očeva posla i zločina počinjenih u koncentracijskom logoru uz njihovu kuću. Kroz Brunove oči, čitatelji svjedoče oštrom kontrastu između privilegiranog života koji on vodi i surove stvarnosti s kojom se suočavaju Shmuel i drugi zatvorenici logora.
Boyneovo portretiranje likova naglašava destruktivne učinke rata i predrasude na pojedince i društvo. Brunova transformacija iz naivnog djeteta u nekoga tko počinje preispitivati svijet oko sebe naglašava važnost obrazovanja i empatije u borbi protiv mržnje i netolerancije. Prijateljstvo između Brune i Shmuela, usprkos preprekama koje im nameću okolnosti, služi kao snažan simbol otpornosti ljudskog duha čak i pred nezamislivom patnjom.
Nadalje, Boyneova upotreba jednostavnog jezika i izravnog pripovijedanja omogućuje ozbiljnosti događaja da duboko odjeknu kod čitatelja, mladih i starih. Predstavljajući užase holokausta kroz leću dječje perspektive, on prenosi dubok utjecaj tih događaja bez pribjegavanja slikovitim opisima. Ovaj pristup naglašava univerzalnu poruku da su rat i netolerancija razorne sile kojima se treba suprotstaviti i eliminirati ih.
Sve u svemu, "Dječak u prugastoj pidžami" služi kao dirljiv podsjetnik na posljedice neprovjerenih predrasuda i mržnje, te snažno zagovara mir, toleranciju i razumijevanje među ljudima iz različitih sredina.