Evo nekih od specifičnih intelektualnih vrijednosti Fantoma iz opere:
* Istraživanje ljubavi i opsesije: Roman istražuje složen odnos između Fantoma i Christine Daaé. Fantom je opsjednut Christine i neće prezati ni pred čime da pridobije njezinu ljubav, čak i ako to znači pribjegavanje nasilju. Christine također privlači Fantom, ali odbija je i njegova mračna strana. Roman istražuje napetost između ljubavi i opsesije i destruktivnu moć obojega.
* Istraživanje prirode umjetnosti: Roman također istražuje prirodu umjetnosti i ulogu umjetnika. Fantom je briljantan glazbenik, ali je i čudovište. Roman postavlja pitanje može li se umjetnost odvojiti od umjetnika i je li moguće da veliki umjetnik bude dobar čovjek.
* Povijesni dokument: Fantom iz opere također je vrijedan povijesni dokument. Omogućuje pogled u svijet Pariza 19. stoljeća i svijet opere. Roman je prepun detalja o arhitekturi Pariza, kostimima opere i životima ljudi koji su radili u kazalištu.
Fantom iz opere složen je i izazovan roman koji nagrađuje pažljivo čitanje i analizu. Riječ je o umjetničkom djelu koje je izdržalo test vremena iu kojem čitatelji diljem svijeta i dalje uživaju.