* Opasnosti prosuđivanja prema izgledu: Priča naglašava kako nas lako početni dojmovi mogu zavesti. Čitatelj, kao i policija, isprva posumnja na nevinog Charlesa McCarthyja na temelju njegova grubog izgleda i činjenice da je bio u svađi s ocem.
* Važnost traženja istine i pravde: Priča naglašava potrebu da se pogleda dalje od površnih prosudbi i pronikne u istinu, ma koliko neugodna ili nezgodna bila. Holmesova metodična istraga otkriva pravog krivca, pokazujući da se pravda ne može postići pretpostavkama.
* Posljedice pohlepe i sebičnosti: Priča pokazuje kako neobuzdana pohlepa i sebičnost mogu dovesti do razornih posljedica. Ubojstvo, vođeno željom za nasljedstvom, naglašava destruktivnu moć pohlepe.
* Krhkost ljudskih odnosa: Priča istražuje složene i često napete odnose između očeva i sinova. Napetost između Charlesa i njegova oca, koja je kulminirala tragedijom, pokazuje ranjivost obiteljskih veza.
* Važnost kritičkog mišljenja i promatranja: Holmesov uspjeh u rješavanju misterija leži u njegovoj sposobnosti da pažljivo promatra detalje i analizira dokaze. On potiče čitatelja na kritičko razmišljanje i ne prihvaćanje izgleda zdravo za gotovo.
U konačnici, misterij doline Boscombe služi kao podsjetnik da izgled može varati i da prava pravda zahtijeva pomnu istragu i spremnost da se preispitaju pretpostavke. Naglašava važnost traženja istine i pravde, čak i kada je to neugodno, te posljedice dopuštanja pohlepi i sebičnosti da pomute našu prosudbu.