1. Legenda o psu: Priča počinje jezivom legendom o monstruoznom psu, za kojeg se kaže da je prokletstvo obitelji Baskerville. Ova se nit u početku čini kao obična folklorna priča, ali ubrzo postaje jasno da krije zlokobnu istinu, povezujući se s aktualnim događajima i nedavnim smrtima.
2. Tajanstvena smrt Sir Charlesa: Iznenadna smrt Sir Charlesa, glave obitelji Baskerville, raspiruje početni strah i sumnju. Prvotna pretpostavka o srčanom udaru dovedena je u pitanje prisutnošću velikog, tajanstvenog otiska stopala i jezivom pričom o teroru Sir Charlesa prije njegove smrti. Ova nit pokreće istragu i priprema pozornicu za dolazak Holmesa i Watsona.
3. Čudno Stapletonovo ponašanje: Zagonetni lik Stapletona, naizgled bezopasnog prirodoslovca koji živi u blizini Baskerville Halla, u početku je predstavljen kao prijateljski raspoložen susjed. Međutim, njegovi postupci, posebice njegovo zanimanje za legendu o psu i njegovo znanje o Sir Charlesovoj smrti, izazivaju sumnju u njegove prave namjere. Ova nit dovodi do njegovog konačnog razotkrivanja kao počinitelja.
Ove tri naizgled odvojene niti spajaju se dok Holmes otkriva misterij. Legenda, smrt i Stapletonovo ponašanje povezani su zlokobnim planom da se ubojstvom naslijedi imanje Baskerville. Rješavanje zagonetke uključuje spajanje ovih niti, što kulminira otkrivanjem prave prirode psa i Stapletonovih motiva.