Kroz cijelu pjesmu, Tankian oslikava živopisnu sliku emocionalne izolacije, gdje su pojedinci zarobljeni u svojim odvojenim stvarnostima, nesposobni da istinski dosegnu ili razumiju jedni druge. On koristi slike fizičkih prostora, kao što su prazni domovi i neplodni krajolici, kako bi zrcalio prazninu koja se osjeća unutra.
Nadalje, razmatra utjecaj tehnologije i površnih veza, ističući kako unatoč životu u doba stalne komunikacije, ostaje šupljina u ljudskim interakcijama.
U konačnici, "Empty Walls" je poziv na dublje, istinske veze, izraz želje da se oslobodimo emocionalnih zidova koji razdvajaju ljude i prigrlimo ispunjenije ljudsko iskustvo. Služi kao snažan podsjetnik na važnost poticanja smislenih odnosa i njegovanja emocionalnog aspekta naših života.