- Brandenburški koncerti br. 1-6, BWV 1046-1051 (oko 1721.)
- Suite za violončelo br. 1-6, BWV 1007-1012 (c.1720-23)
- Dobro temperirani klavir, 1. i 2. knjiga, BWV 846-893 (1722., 1744.)
- Goldbergove varijacije, BWV 988 (oko 1741.-42.)
- Misa u h-molu, BWV 232 (oko 1733.-38.)
- Muka po Mateju, BWV 244 (1727.)
- Muka po Ivanu, BWV 245 (1724.)
- Orkestralne suite br. 1-4, BWV 1066-1069 (c.1725-30)
- Francuske suite, BWV 812-817 (oko 1725.)
- Engleske suite, BWV 806-811 (oko 1715.)
- Partita za solo violinu, BWV 1002-1006 (oko 1720.)
- Sonate i partite za solo violinu, BWV 1001-1006 (oko 1720.)