Jedna od najpopularnijih teorija je da su Beatlesi koristili backmasking, tehniku u kojoj se poruka snima unatrag tako da se može čuti kada se svira unatrag. Obožavatelji su tvrdili da čuju razne skrivene poruke kada puštaju pjesme Beatlesa unatrag, uključujući fraze poput "Turn me on, dead man" u "Revolution 9" i "I buried Paul" u "Strawberry Fields Forever". O ovim se tvrdnjama naširoko raspravljalo i neki su ih odbacili kao pareidoliju, sklonost uočavanju smislenih obrazaca u nasumičnim ili nepovezanim informacijama.
Druga teorija sugerira da su Beatlesi ostavili vizualne tragove i simboliku u svojim naslovnicama albuma i promotivnom materijalu. Neki fanovi vjeruju da naslovnica "Sergeant Pepper's Lonely Hearts Club Band" sadrži skrivenu sliku čovjeka koji stoji u gomili leđima okrenut gledatelju, za kojeg neki vjeruju da predstavlja Paula McCartneyja. Drugi su protumačili simbole ili objekte na naslovnicama albuma kao što su "Abbey Road" i "Revolver" kao da nose tajanstvene poruke.
Dodatno, neki obožavatelji analizirali su tekstove pjesama Beatlesa, sugerirajući da sadrže prikrivene reference na osobna iskustva, društvene komentare ili skrivena značenja. Tumačenje stihova može biti vrlo subjektivno, i dok određene pjesme mogu rezonirati s pojedincima na različite načine, često je teško utvrditi jesu li ta tumačenja bila namjera benda.
Vrijedno je napomenuti da su stručnjaci i kritičari naširoko raspravljali, analizirali i odbacili mnoge od tih skrivenih poruka i teorija. Sami Beatlesi nikada nisu službeno potvrdili niti demantirali ove spekulacije, ostavljajući njihovu pravu prirodu otvorenom za tumačenje. U konačnici, vjeruje li netko u postojanje skrivenih poruka u albumima Beatlesa ostaje stvar osobne perspektive i individualne percepcije.