* Rex Goodwin: Vođa Dark Signersa i glavni antagonist serije.
* Devack: Prvi Dark Signer koji se pojavio i bivši prijatelj Yuseija Fuda.
* Roman Goodwin: Rexov brat i drugi Dark Signer koji se pojavio.
* Kalinin: Ruski mračni potpisnik koji koristi tamnu kartu za manipuliranje drugima.
* Misty: Tajanstvena žena koja se pojavljuje kao peti Dark Signer.
* Z-jedan: Moćno biće iz budućnosti koje orkestrira događaje u seriji. On tehnički nije Dark Signer, ali ima jaku vezu s njima.
* Antinomija: Zagonetna figura koja se pojavljuje uz Z-onea, a povezana je i s Dark Signersima.
Važno je napomenuti da dok su Dark Signers primarni antagonisti, Z-one i Antinomy su složeniji likovi sa svojim motivima.