Film počinje 1970-ih kada Steve Jobs i Steve Wozniak rade u garaži Jobsovih roditelja, razvijajući računalo Apple I. Jobs je prikazan kao vizionar i perfekcionist, dok je Wozniak prikazan kao tehnički genij iza njihovih kreacija.
U međuvremenu, Bill Gates je student koji je napustio Harvard i sa svojim prijateljem iz djetinjstva Paulom Allenom osniva Microsoft 1975. Gates je prikazan kao lukav poslovni čovjek s intenzivnom željom za uspjehom.
Kako Apple i Microsoft rastu, rivalstvo između Jobsa i Gatesa se pojačava. Jobs je odlučan stvoriti revolucionarno računalo prilagođeno korisniku, dok se Gates fokusira na izradu softvera koji može raditi na bilo kojoj hardverskoj platformi.
Film prati lansiranje Appleovog Macintosha 1984., razvoj Microsoft Windowsa i uspon grafičkih korisničkih sučelja (GUI). Također uključuje dramatizacije ključnih događaja kao što je poznati sastanak "Homebrew Computer Club" na kojem Jobs prvi put demonstrira Apple I, projekt "Lisa" i pravne bitke između Applea i Microsofta oko prava intelektualnog vlasništva.
Tijekom filma, Jobsova opsjednutost savršenstvom i njegov beskompromisan stav često dovode do sukoba s njegovim kolegama i zaposlenicima. Gates je, s druge strane, prikazan kao pragmatičniji i proračunatiji vođa koji je spreman na kompromise kako bi postigao svoje ciljeve.
"Pirati iz Silicijske doline" nude pronicljiv pogled na rane dane tehnološke industrije, prikazujući strast, ambiciju i rivalstvo koji su oblikovali razvoj osobnih računala i softvera. Film ističe doprinose Jobsa, Gatesa i drugih vizionara koji su revolucionirali digitalno doba.