Radnja Sveučilišta čudovišta je sljedeća:
James P. "Sully" Sullivan i njegov najbolji prijatelj, Michael "Mike" Wazowski, primljeni su na Sveučilište čudovišta. Obojica se žele pridružiti Roar Omega Roar (ROR), vrhunskom zastrašujućem bratstvu, ali su odbijeni jer nisu dovoljno strašni. Pridružuju se Oozma Kappi (OK), bratstvu koje se sastoji od neprilagođenih i otpadnika. Suly i Mike postaju bliski prijatelji i uče raditi zajedno. Također uče da plašenje nije najvažnija stvar u životu; prijateljstvo i timski rad su važniji.