1. Nobelova nagrada za mir:2001. godine WHO je zajedno s Ujedinjenim narodima dobio Nobelovu nagradu za mir za njihov rad u "organiziranju i usmjeravanju globalnih zdravstvenih napora u borbi protiv HIV/AIDS-a, malarije i drugih bolesti."
2. Nagrada Prince Mahidol:Nagrada Prince Mahidol jedna je od najprestižnijih svjetskih zdravstvenih nagrada, koju dodjeljuje Zaklada Prince Mahidol Award na Tajlandu. WHO je više puta dobio nagradu Prince Mahidol, uključujući 1995., 2001. i 2010. godine.
3. Sasakawa Health Prize:Sasakawa Health Prize, koju dodjeljuje The Sasakawa Health Foundation, odaje priznanje pojedincima i organizacijama koji su značajno doprinijeli globalnom zdravlju. WHO je nekoliko puta nagrađen nagradom Sasakawa Health Prize, uključujući 1999., 2007. i 2012. godine.
4. Memorijalna nagrada dr. Lee Jong-wooka za javno zdravstvo:Ovu nagradu, koju je uspostavila Vlada Republike Koreje, dodjeljuje se pojedincima ili organizacijama koji su dali izniman doprinos javnom zdravstvu. SZO je u nekoliko navrata dobila Memorijalnu nagradu dr. Lee Jong-wooka, uključujući 2007., 2012. i 2017. godinu.
5. Gatesova nagrada za globalno zdravlje:Zaklada Bill &Melinda Gates osnovala je Gatesovu nagradu za globalno zdravlje kako bi prepoznala i podržala iznimne lidere u području globalnog zdravlja. SZO je više puta primila Gatesovu nagradu, uključujući 2007. i 2012.
Vrijedno je napomenuti da Svjetska zdravstvena organizacija nastavlja primati razne nagrade, priznanja i počasti od vlada, organizacija i zaklada širom svijeta kao priznanje za svoje stalne napore da poboljša globalno zdravlje i dobrobit.